Le metapneumovirus humain (hMPV), decrit pour la premiere fois en 2001 par l’equipe du Pr Albert Osterhaus [1], est l’un des principaux pathogenes infectieux responsables des atteintes respiratoires aigues chez l’homme. Sa circulation au sein de la population survient habituellement durant les periodes hivernales et printanieres en regions temperees. Dans certains cas, les pneumonies secondaires au hMPV peuvent s’averer mortelles comme chez les patients âges ou immunodeprimes. Le pathogene humain le plus proche, genetiquement, du hMPV est le virus respiratoire syncytial (hRSV), responsable notamment de bronchiolites et de pneumonies chez le jeune enfant. Le diagnostic du hMPV se fait generalement par RT-PCR en raison de la difficulte a le cultiver in vitro. Les virus sont classes genetiquement en deux groupes principaux (A et B) bases principalement sur la variabilite de sequence des glycoproteines de surface. Comme tous les Paramyxoviridae, le hMPV possede un genome a ARN simple brin de polarite negative et comprend huit genes codant neuf proteines distinctes. Son organisation genomique et les fonctions de ses glycoproteines d’attachement et de fusion sont relativement similaires a celles du hRSV. Malgre de nombreuses donnees recentes sur le cycle viral du hMPV, il reste encore de nombreuses questions fondamentales sans reponse et notamment sur les roles exacts des glycoproteines de surface F et G dans l’attachement a la cellule cible et la fusion membranaire. Il n’existe a l’heure actuelle aucun traitement ayant une autorisation de mise sur le marche pour combattre les infections a hMPV. La majorite des traitements en cours d’evaluation contre le hMPV ont deja demontre un interet preventif ou therapeutique contre hRSV. Alternativement, certaines approches innovantes basees notamment sur les inhibiteurs de fusion et l’interference a l’ARN pourraient se reveler efficaces. Sur le plan de la vaccination, l’un des obstacles majeurs resulte en la difficulte d’induire une reponse immunitaire durable contre hMPV. Plusieurs nouvelles strategies vaccinales telles que les virus vivants attenues generes par genetique inverse et l’injection de proteines recombinantes ont ete testees chez l’animal avec un certain succes, permettant d’envisager un developpement clinique de ces nouveaux produits.

Malgre des progres impressionnants en matiere de prevention et de traitement des dysplasies precancereuses et des cancers, le cancer du col demeure un probleme de sante publique a l’echelle mondiale. Le developpement de lesions dysplasiques et du cancer du col est lie a la presence de papillomavirus humain (HPV) exprimant les oncogenes viraux E6 et E7. Ces antigenes viraux sont tres attrayants comme candidats dans le developpement de vaccins therapeutiques. Differentes strategies vaccinales ont ete developpees reposant sur l’utilisation de vecteurs vivants (viraux ou bacteriens), de proteines, de peptides, d’ADN ou encore de cellules dendritiques ou tumorales. A ce jour, de nombreux essais cliniques ont ete realises avec des candidats vaccins, ciblant principalement les lesions precancereuses et les cancers. Bien que les strategies utilisees aient permis, pour la plupart, d’induire une reponse cellulaire T chez les patients, le succes des vaccins therapeutiques a ete jusqu’ici relativement limite. La strategie vaccinale devra etre redefinie dans l’avenir avec une application a des stades plus precoces de la maladie et l’utilisation de strategies combinees. Les vaccins therapeutiques s’integreront vraisemblablement dans une prise en charge globale des lesions precancereuses et cancereuses du col.

Le rotavirus du groupe A est la cause majeure de gastro-enterite aigue severe chez le jeune enfant partout dans le monde, estimee a l’origine d’environ 500 000 deces chaque annee, la majorite dans les pays a faible niveau socio-economique. Deux vaccins vivants administres par voie orale sont actuellement disponibles, un vaccin monovalent base sur une souche humaine attenuee (Rotarix ®, GSK Biologicals) et un vaccin pentavalent comprenant cinq souches reassortantes bovine-humaines (Rotateq ®, Sanofi Pasteur MSD). Ces vaccins ont ete recommandes en 2006 par l’OMS dans les pays ou les premiers essais cliniques avaient montre une bonne efficacite et une bonne tolerance (Europe, Amerique du Nord et du Sud). Les donnees d’impact (observations du terrain) actuellement disponibles pour ces pays suggerent que ces vaccins pourraient avoir un impact majeur sur les diarrhees severes. En 2009, les recommandations OMS ont ete etendues a tous les pays. Les questions non resolues a ce jour sont l’efficacite de la vaccination en Afrique et en Asie ou la mortalite est la plus elevee, des donnees recentes ayant montre qu’elle etait inferieure dans ces regions, l’evolution possible des souches sous la pression de selection de la vaccination, et le risque reel d’invagination intestinale aigue lie a la vaccination. En France actuellement, la vaccination n’est pas encore recommandee chez tous les nourrissons.

Apres la diminution spectaculaire de la rougeole grâce a la vaccination, celle-ci est reapparue en 2008, ou 604 cas ont ete declares a l’Institut national de veille sanitaire (InVS), puis 1 544 cas en 2009 et 2 605 jusqu’en juin 2010. Parallelement, 86 souches virales ont ete identifiees au Centre national de reference de la rougeole et des Paramyxoviridae respiratoires (CNR) a partir de prelevements salivaires en 2008, 316 en 2009 et 946 jusqu’en aoUt 2010. La realite de l’epidemie est etayee par l’accroissement des cas endemiques : 0,9 cas pour 100 000 habitants en 2008 et quatre en 2010, la diffusion a toutes les regions francaises, et l’atteinte plus specifique des petits nourrissons : 4 % en 2008 et 9 % en 2010, et des sujets âges de 20 ans ou plus : 17 % en 2008 et 38 % en 2010. La majorite des cas (82 %) survient evidemment chez des sujets non vaccines contre la rougeole. Le nombre de cas hospitalises a augmente passant de 18 % en 2008 a 34 % en 2010. Le virus de l’epidemie est un genotype D4. Il apparait en 2008, puis s’etend en 2009 et 2010, representant 19, 75 et 99 % des virus caracterises. Tous les virus de ce genotype sont proches de la souche Montreal.CAN/89xD4 decrite en 1989. Au debut de l’epidemie en France, dans la region de Reims, quelques souches etaient proches du variant identifie en Angleterre en 2007 : MVs/Enfield.GBR/14.07(D4). Mais aujourd’hui la grande majorite d’entre elles (95 %) sont identiques a un variant qui a cause un petit foyer de rougeoles en Vendee au dernier trimestre 2008 : MVs/Montaigu.FRA/43.08(D4). Le diagnostic salivaire, qui a ete introduit en France a l’occasion de la declaration obligatoire de la rougeole, est tres efficace : 75 % des echantillons sont preleves dans les quatre premiers jours de l’eruption, et la recherche de l’ARN est positive dans 536 (81 %) des 660 salives recues au CNR jusqu’a ce jour en 2010 ; 136 (21 %) des salives contiennent des IgM anti-rougeole et 18 % n’ont ni ARN, ni IgM.

Les arterivirus forment un groupe de petits virus enveloppes avec un genome compose d'une molecule d'ARN simple brin de polarite positive avec la presence d'une structure chapeau en 5’ et d'une queue polyadenylee en 3’. Ces virus appartiennent a la famille Arteriviridae qui, avec les familles Coronaviridae et Roniviridae, constitue l'ordre Nidovirales. Les arterivirus ont un tropisme particulier pour les macrophages et induisent des infections persistantes. Divers travaux ont permis de mieux comprendre l'organisation genomique de ces virus et leurs modes de replication et de transcription, incluant la synthese d'ARNm viraux sous-genomiques pour la production des proteines virales structurales. De nombreuses sequences sont maintenant disponibles pour ces virus. De plus, des etudes portant sur la modulation de la reponse immunitaire innee par les arterivirus demontrent le role de plus en plus important des proteines virales non structurales dans ce processus. Finalement, certains mecanismes pro et anti-apoptotiques des arterivirus ont ete elucides mais leurs roles dans la pathogenese virale restent a determiner.

Les modifications post-traductionnelles, telles que la SUMOylation, sont un exemple de machinerie cellulaire detournee par les virus. La SUMOylation, qui consiste en la liaison covalente d'un peptide SUMO (small ubiquitin-like modifier) a une proteine cible, a recemment ete impliquee dans le cycle replicatif de nombreux virus. Cette revue rappelle, par des exemples choisis a travers le monde viral et en insistant sur les dernieres decouvertes, les differentes facons dont la SUMOylation est detournee par les virus afin de creer un environnement favorable a la replication. Le lien entre les pathologies impliquees par chaque virus et la SUMOylation est aborde. Enfin, les dernieres avancees concernant l'utilisation des potentiels inhibiteurs de la SUMOylation dans le cadre de la lutte antivirale et anticancereuse sont evoquees.

Le candidat vaccin tetravalent (TV) contre la dengue de Sanofi Pasteur est un vaccin recombinant vivant attenue. Il est constitue de quatre vaccins monovalents possedant la machinerie replicative du virus vaccinal fievre jaune 17D, et exprimant les genes d'enveloppe de chacun des quatre serotypes du virus de la dengue. Ce candidat vaccin est genetiquement stable, non viscerotrope, et n'est pas transmis par les moustiques vecteurs de la dengue. Son immunogenicite et son innocuite ont ete demontrees dans differents modeles precliniques in vitro et in vivo, ainsi que lors de plusieurs essais cliniques. A cet egard, un programme de developpement clinique d'envergure est en cours, incluant un premier essai d'efficacite en Thailande, dans une province a forte incidence de dengue. Cet essai sera suivi de plusieurs essais a large echelle en Asie et en Amerique du Sud. En cas de resultats positifs, la premiere soumission pour enregistrement de ce vaccin aux autorites de sante est envisageable dans les cinq ans.

Les resistances genetiques ont permis de reduire fortement l'impact des maladies virales chez de nombreuses plantes cultivees. Leur introduction dans les varietes commerciales a ete facilitee par le controle genetique simple de beaucoup d'entre elles. Cependant, comme pour tout couple hote-parasite, les virus s'adaptent a ces resistances, meme si la durabilite de ces dernieres, c'est-a-dire le temps pendant lequel elles demeurent efficaces en condition de culture, est tres variable. Durant les deux dernieres decennies, l'application des methodes d'analyse genetique aux virus de plantes a permis de reveler les mecanismes moleculaires a l'origine de ces adaptations et laisse esperer des avancees prochaines dans la prediction de la durabilite des resistances. Si, a l'echelle de la plante, les mecanismes generant les variants viraux adaptes sont desormais identifies, les mecanismes impliques dans l'emergence de populations virales contournant ces resistances a l'echelle de l'agroecosysteme restent largement meconnus. Une meilleure comprehension de la valeur competitive des genotypes viraux, adaptes ou non aux resistances, pour l'infection de leurs plantes hotes et leur capacite de dissemination dans l'agroecosysteme est ainsi necessaire. Les difficultes de l'analyse experimentale de ces phenomenes imposent le recours a la modelisation mathematique pour definir par exemple des strategies spatiotemporelles optimales de deploiement des varietes cultivees.

Auteur(s) : Frederic Morinet, Michel Marty Hopital Saint-Louis, AP-HP, CITOH, 1, avenue Claude-Vellefaux, 75010 Paris, France La relation entre le virus d’Epstein-Barr (EBV) et le cancer du cavum (ou rhinopharynx) est bien etablie. Pourtant, les mecanismes de l'oncogenese mise en œuvre dans l'apparition de la tumeur aussi bien que son diagnostic ou son traitement continuent a poser de nombreuses questions qu'il est utile de revoir brievement a la lumiere des dernieres donnees [...]